RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343820.9

TGIF1-202, Transcript of TGFB induced factor homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TGIF1, Length 2,076 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF1-202ENST00000343820 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64,38■■■■■ 7,9
TGIF1-202ENST00000343820 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55,6■■■■■ 6,49
TGIF1-202ENST00000343820 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54,43■■■■■ 6,3
TGIF1-202ENST00000343820 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53,88■■■■■ 6,22
TGIF1-202ENST00000343820 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53,15■■■■■ 6,1
TGIF1-202ENST00000343820 ABCC9O60706 1549 aa53,09■■■■■ 6,09
TGIF1-202ENST00000343820 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52,71■■■■■ 6,03
TGIF1-202ENST00000343820 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP52,65■■■■■ 6,02
TGIF1-202ENST00000343820 MYO15BQ96JP2 1530 aa51,97■■■■■ 5,91
TGIF1-202ENST00000343820 NACADO15069 1562 aa51,88■■■■■ 5,9
TGIF1-202ENST00000343820 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51,61■■■■■ 5,85
TGIF1-202ENST00000343820 SCRIBQ14160 1630 aa51,26■■■■■ 5,8
TGIF1-202ENST00000343820 CHIC1Q5VXU3 224 aa51,25■■■■■ 5,8
TGIF1-202ENST00000343820 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50,64■■■■■ 5,7
TGIF1-202ENST00000343820 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50,62■■■■■ 5,69
TGIF1-202ENST00000343820 BICRAQ9NZM4 1560 aa50,07■■■■■ 5,61
TGIF1-202ENST00000343820 CECR2Q9BXF3 1484 aa49,96■■■■■ 5,59
TGIF1-202ENST00000343820 MROH2BQ7Z745 1585 aa49,88■■■■■ 5,57
TGIF1-202ENST00000343820 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49,87■■■■■ 5,57
TGIF1-202ENST00000343820 WIZO95785 1651 aa49,64■■■■■ 5,54
TGIF1-202ENST00000343820 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49,56■■■■■ 5,52
TGIF1-202ENST00000343820 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa49,44■■■■■ 5,5
TGIF1-202ENST00000343820 TRIM41Q8WV44 630 aa49,3■■■■■ 5,48
TGIF1-202ENST00000343820 SMARCA4P51532 1647 aa49,19■■■■■ 5,47
TGIF1-202ENST00000343820 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49,04■■■■■ 5,44
TGIF1-202ENST00000343820 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49,02■■■■■ 5,44
TGIF1-202ENST00000343820 PCGF6Q9BYE7 350 aa49■■■■■ 5,43
TGIF1-202ENST00000343820 HRCP23327 699 aa48,95■■■■■ 5,43
TGIF1-202ENST00000343820 SMARCA2P51531 1590 aa48,69■■■■■ 5,38
TGIF1-202ENST00000343820 CCDC88BA6NC98 1476 aa48,59■■■■■ 5,37
TGIF1-202ENST00000343820 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP48,55■■■■■ 5,36
TGIF1-202ENST00000343820 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP48,48■■■■■ 5,35
TGIF1-202ENST00000343820 PEG3Q9GZU2 1588 aa48,44■■■■■ 5,34
TGIF1-202ENST00000343820 ABCC8Q09428 1581 aa48,23■■■■■ 5,31
TGIF1-202ENST00000343820 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48,15■■■■■ 5,3
TGIF1-202ENST00000343820 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48,07■■■■■ 5,29
TGIF1-202ENST00000343820 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47,89■■■■■ 5,26
TGIF1-202ENST00000343820 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47,86■■■■■ 5,25
TGIF1-202ENST00000343820 NCAPD3P42695 1498 aa47,84■■■■■ 5,25
TGIF1-202ENST00000343820 HMGXB3Q12766 1538 aa47,78■■■■■ 5,24
TGIF1-202ENST00000343820 EEA1Q15075 1411 aa47,74■■■■■ 5,23
TGIF1-202ENST00000343820 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP47,63■■■■■ 5,22
TGIF1-202ENST00000343820 SOGA1O94964 1423 aa47,62■■■■■ 5,21
TGIF1-202ENST00000343820 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47,58■■■■■ 5,213e-13■■■■■ 117
TGIF1-202ENST00000343820 SYNJ1O43426 1573 aa47,42■■■■■ 5,18
TGIF1-202ENST00000343820 TNIKQ9UKE5 1360 aa47,39■■■■■ 5,18
TGIF1-202ENST00000343820 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP47,39■■■■■ 5,18
TGIF1-202ENST00000343820 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47,38■■■■■ 5,17
TGIF1-202ENST00000343820 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47,36■■■■■ 5,17
TGIF1-202ENST00000343820 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47,36■■■■■ 5,17
TGIF1-202ENST00000343820 CEP162Q5TB80 1403 aa47,32■■■■■ 5,17
TGIF1-202ENST00000343820 GOLGA3Q08378 1498 aa47,23■■■■■ 5,15
TGIF1-202ENST00000343820 KIF21BO75037 1637 aa47,14■■■■■ 5,14
TGIF1-202ENST00000343820 TOP2BQ02880 1626 aa47,04■■■■■ 5,12
TGIF1-202ENST00000343820 CEP164Q9UPV0 1460 aa47,04■■■■■ 5,12
TGIF1-202ENST00000343820 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46,99■■■■■ 5,11
TGIF1-202ENST00000343820 UBTFP17480 764 aaKnown RBP46,96■■■■■ 5,11
TGIF1-202ENST00000343820 PRDM2Q13029 1718 aa46,64■■■■■ 5,06
TGIF1-202ENST00000343820 CFTRP13569 1480 aa46,6■■■■■ 5,05
TGIF1-202ENST00000343820 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46,57■■■■■ 5,04
TGIF1-202ENST00000343820 CADPSQ9ULU8 1353 aa46,56■■■■■ 5,04
TGIF1-202ENST00000343820 CLIP1P30622 1438 aa46,54■■■■■ 5,04
TGIF1-202ENST00000343820 CUX1P39880 1505 aa46,51■■■■■ 5,04
TGIF1-202ENST00000343820 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46,47■■■■■ 5,03
TGIF1-202ENST00000343820 NESP48681 1621 aa46,4■■■■■ 5,02
TGIF1-202ENST00000343820 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46,38■■■■■ 5,02
TGIF1-202ENST00000343820 VPS8Q8N3P4 1428 aa46,38■■■■■ 5,02
TGIF1-202ENST00000343820 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP46,34■■■■■ 5,01
TGIF1-202ENST00000343820 PRXQ9BXM0 1461 aa46,34■■■■■ 5,01
TGIF1-202ENST00000343820 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP46,31■■■■■ 5
TGIF1-202ENST00000343820 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP46,31■■■■■ 5
TGIF1-202ENST00000343820 KIF27Q86VH2 1401 aa46,2■■■■■ 4,99
TGIF1-202ENST00000343820 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46,07■■■■■ 4,97
TGIF1-202ENST00000343820 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45,99■■■■■ 4,95
TGIF1-202ENST00000343820 APLP2Q06481 763 aa45,94■■■■■ 4,94
TGIF1-202ENST00000343820 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45,93■■■■■ 4,94
TGIF1-202ENST00000343820 ARAP1Q96P48 1450 aa45,91■■■■■ 4,94
TGIF1-202ENST00000343820 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP45,78■■■■■ 4,92
TGIF1-202ENST00000343820 CUX2O14529 1486 aa45,74■■■■■ 4,91
TGIF1-202ENST00000343820 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45,73■■■■■ 4,91
TGIF1-202ENST00000343820 IGF1RP08069 1367 aa45,62■■■■■ 4,89
TGIF1-202ENST00000343820 ERCC6Q03468 1493 aa45,59■■■■■ 4,89
TGIF1-202ENST00000343820 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa45,58■■■■■ 4,89
TGIF1-202ENST00000343820 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45,57■■■■■ 4,89
TGIF1-202ENST00000343820 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP45,54■■■■■ 4,88
TGIF1-202ENST00000343820 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45,54■■■■■ 4,88
TGIF1-202ENST00000343820 TOPBP1Q92547 1522 aa45,51■■■■■ 4,88
TGIF1-202ENST00000343820 MRC2Q9UBG0 1479 aa45,47■■■■■ 4,87
TGIF1-202ENST00000343820 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45,43■■■■■ 4,86
TGIF1-202ENST00000343820 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45,33■■■■■ 4,85
TGIF1-202ENST00000343820 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45,32■■■■■ 4,84
TGIF1-202ENST00000343820 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP45,3■■■■■ 4,84
TGIF1-202ENST00000343820 WDR62O43379 1518 aa45,28■■■■■ 4,84
TGIF1-202ENST00000343820 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP45,28■■■■■ 4,84
TGIF1-202ENST00000343820 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45,24■■■■■ 4,83
TGIF1-202ENST00000343820 MAP3K1Q13233 1512 aa45,24■■■■■ 4,83
TGIF1-202ENST00000343820 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP45,19■■■■■ 4,82
TGIF1-202ENST00000343820 CUL7Q14999 1698 aa45,18■■■■■ 4,82
TGIF1-202ENST00000343820 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45,15■■■■■ 4,82
TGIF1-202ENST00000343820 TIAM1Q13009 1591 aa45,14■■■■■ 4,82
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