Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPRTNQ9H040 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPRTNQ9H040 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPRTNQ9H040 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms