Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLVAPQ9BX97 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLVAPQ9BX97 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLVAPQ9BX97 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLVAPQ9BX97 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLVAPQ9BX97 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLVAPQ9BX97 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLVAPQ9BX97 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLVAPQ9BX97 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLVAPQ9BX97 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLVAPQ9BX97 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLVAPQ9BX97 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLVAPQ9BX97 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLVAPQ9BX97 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLVAPQ9BX97 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLVAPQ9BX97 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLVAPQ9BX97 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PLVAPQ9BX97 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLVAPQ9BX97 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLVAPQ9BX97 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLVAPQ9BX97 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PLVAPQ9BX97 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
PLVAPQ9BX97 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms