Protein–RNA interactions for Protein: Q99741

CDC6, Cell division control protein 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC6Q99741 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC6Q99741 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC6Q99741 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC6Q99741 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms