Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A3Q99624 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC38A3Q99624 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A3Q99624 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms