Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ASIC4Q96FT7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ASIC4Q96FT7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASIC4Q96FT7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASIC4Q96FT7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASIC4Q96FT7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASIC4Q96FT7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASIC4Q96FT7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ASIC4Q96FT7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASIC4Q96FT7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.1 ms