Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LMBR1Q8WVP7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMBR1Q8WVP7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMBR1Q8WVP7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMBR1Q8WVP7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms