Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PHTF2Q8N3S3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PHTF2Q8N3S3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHTF2Q8N3S3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms