Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS6

RAB43, Ras-related protein Rab-43, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB43Q86YS6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB43Q86YS6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB43Q86YS6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB43Q86YS6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms