Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS6

RAB43, Ras-related protein Rab-43, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB43Q86YS6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RAB43Q86YS6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RAB43Q86YS6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RAB43Q86YS6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RAB43Q86YS6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RAB43Q86YS6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RAB43Q86YS6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RAB43Q86YS6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
RAB43Q86YS6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RAB43Q86YS6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RAB43Q86YS6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RAB43Q86YS6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RAB43Q86YS6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RAB43Q86YS6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RAB43Q86YS6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RAB43Q86YS6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RAB43Q86YS6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RAB43Q86YS6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RAB43Q86YS6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RAB43Q86YS6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAB43Q86YS6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAB43Q86YS6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAB43Q86YS6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAB43Q86YS6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAB43Q86YS6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAB43Q86YS6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAB43Q86YS6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAB43Q86YS6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAB43Q86YS6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAB43Q86YS6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAB43Q86YS6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAB43Q86YS6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB43Q86YS6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB43Q86YS6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB43Q86YS6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB43Q86YS6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RAB43Q86YS6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB43Q86YS6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB43Q86YS6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAB43Q86YS6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAB43Q86YS6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAB43Q86YS6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RAB43Q86YS6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RAB43Q86YS6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RAB43Q86YS6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB43Q86YS6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RAB43Q86YS6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB43Q86YS6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB43Q86YS6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAB43Q86YS6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB43Q86YS6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAB43Q86YS6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB43Q86YS6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB43Q86YS6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB43Q86YS6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB43Q86YS6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB43Q86YS6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB43Q86YS6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RAB43Q86YS6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB43Q86YS6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB43Q86YS6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB43Q86YS6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB43Q86YS6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RAB43Q86YS6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB43Q86YS6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB43Q86YS6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB43Q86YS6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB43Q86YS6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB43Q86YS6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB43Q86YS6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB43Q86YS6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB43Q86YS6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB43Q86YS6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB43Q86YS6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB43Q86YS6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB43Q86YS6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB43Q86YS6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB43Q86YS6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB43Q86YS6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB43Q86YS6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB43Q86YS6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB43Q86YS6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB43Q86YS6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB43Q86YS6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB43Q86YS6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB43Q86YS6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB43Q86YS6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB43Q86YS6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB43Q86YS6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB43Q86YS6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB43Q86YS6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB43Q86YS6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB43Q86YS6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB43Q86YS6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAB43Q86YS6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB43Q86YS6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB43Q86YS6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB43Q86YS6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB43Q86YS6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB43Q86YS6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms