Protein–RNA interactions for Protein: Q6WKZ4

RAB11FIP1, Rab11 family-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP1Q6WKZ4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP1Q6WKZ4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB11FIP1Q6WKZ4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP1Q6WKZ4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms