Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC174Q6PII3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC174Q6PII3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms