Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM68Q6AZZ1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM68Q6AZZ1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms