Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITRM1Q5JRX3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PITRM1Q5JRX3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms