Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCM1Q15154 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCM1Q15154 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms