Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PAX8Q06710 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms