Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP46P62068 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP46P62068 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP46P62068 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP46P62068 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP46P62068 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP46P62068 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP46P62068 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP46P62068 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP46P62068 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP46P62068 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP46P62068 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP46P62068 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP46P62068 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP46P62068 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP46P62068 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP46P62068 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP46P62068 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP46P62068 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP46P62068 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP46P62068 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP46P62068 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
USP46P62068 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP46P62068 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP46P62068 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP46P62068 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP46P62068 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP46P62068 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP46P62068 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP46P62068 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP46P62068 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP46P62068 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP46P62068 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP46P62068 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP46P62068 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP46P62068 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP46P62068 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP46P62068 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP46P62068 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP46P62068 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP46P62068 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP46P62068 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP46P62068 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP46P62068 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP46P62068 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP46P62068 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP46P62068 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP46P62068 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP46P62068 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP46P62068 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP46P62068 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP46P62068 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP46P62068 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP46P62068 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP46P62068 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP46P62068 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP46P62068 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP46P62068 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP46P62068 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP46P62068 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP46P62068 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP46P62068 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP46P62068 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP46P62068 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP46P62068 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP46P62068 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP46P62068 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP46P62068 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP46P62068 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP46P62068 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP46P62068 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP46P62068 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP46P62068 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP46P62068 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP46P62068 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP46P62068 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP46P62068 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP46P62068 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP46P62068 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP46P62068 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP46P62068 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP46P62068 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP46P62068 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP46P62068 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP46P62068 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP46P62068 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP46P62068 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP46P62068 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP46P62068 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP46P62068 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP46P62068 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP46P62068 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP46P62068 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP46P62068 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP46P62068 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP46P62068 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP46P62068 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP46P62068 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP46P62068 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP46P62068 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms