Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CHMP4BP1P59074 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHMP4BP1P59074 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHMP4BP1P59074 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP4BP1P59074 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms