Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A3P53794 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC5A3P53794 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC5A3P53794 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms