Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC19A1P41440 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC19A1P41440 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms