Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TGFB3P10600 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TGFB3P10600 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TGFB3P10600 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TGFB3P10600 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TGFB3P10600 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TGFB3P10600 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TGFB3P10600 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TGFB3P10600 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TGFB3P10600 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TGFB3P10600 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TGFB3P10600 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TGFB3P10600 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TGFB3P10600 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TGFB3P10600 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TGFB3P10600 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TGFB3P10600 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TGFB3P10600 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TGFB3P10600 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms