Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39■■■■□ 3.83
TGFB3P10600 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TGFB3P10600 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TGFB3P10600 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TGFB3P10600 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TGFB3P10600 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TGFB3P10600 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
TGFB3P10600 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TGFB3P10600 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TGFB3P10600 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TGFB3P10600 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TGFB3P10600 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TGFB3P10600 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TGFB3P10600 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TGFB3P10600 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
TGFB3P10600 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TGFB3P10600 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TGFB3P10600 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TGFB3P10600 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TGFB3P10600 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TGFB3P10600 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TGFB3P10600 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TGFB3P10600 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TGFB3P10600 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TGFB3P10600 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TGFB3P10600 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TGFB3P10600 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TGFB3P10600 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TGFB3P10600 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TGFB3P10600 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TGFB3P10600 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TGFB3P10600 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TGFB3P10600 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TGFB3P10600 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TGFB3P10600 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TGFB3P10600 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TGFB3P10600 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
TGFB3P10600 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TGFB3P10600 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TGFB3P10600 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
TGFB3P10600 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TGFB3P10600 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TGFB3P10600 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TGFB3P10600 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TGFB3P10600 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
TGFB3P10600 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TGFB3P10600 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TGFB3P10600 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TGFB3P10600 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TGFB3P10600 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TGFB3P10600 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TGFB3P10600 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TGFB3P10600 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TGFB3P10600 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TGFB3P10600 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TGFB3P10600 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TGFB3P10600 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TGFB3P10600 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
TGFB3P10600 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TGFB3P10600 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TGFB3P10600 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TGFB3P10600 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TGFB3P10600 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TGFB3P10600 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TGFB3P10600 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TGFB3P10600 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TGFB3P10600 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TGFB3P10600 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
TGFB3P10600 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TGFB3P10600 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TGFB3P10600 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TGFB3P10600 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TGFB3P10600 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TGFB3P10600 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TGFB3P10600 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TGFB3P10600 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TGFB3P10600 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TGFB3P10600 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TGFB3P10600 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TGFB3P10600 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TGFB3P10600 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TGFB3P10600 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TGFB3P10600 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TGFB3P10600 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TGFB3P10600 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TGFB3P10600 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TGFB3P10600 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TGFB3P10600 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TGFB3P10600 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TGFB3P10600 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TGFB3P10600 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TGFB3P10600 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
TGFB3P10600 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TGFB3P10600 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TGFB3P10600 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
TGFB3P10600 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TGFB3P10600 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TGFB3P10600 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TGFB3P10600 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TGFB3P10600 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms