Protein–RNA interactions for Protein: P05166

PCCB, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCBP05166 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCCBP05166 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCCBP05166 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCCBP05166 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCCBP05166 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCCBP05166 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCCBP05166 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCBP05166 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCBP05166 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCBP05166 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCBP05166 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCCBP05166 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCBP05166 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCBP05166 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCBP05166 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCBP05166 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCBP05166 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCCBP05166 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCCBP05166 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCCBP05166 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCCBP05166 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCCBP05166 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCCBP05166 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCCBP05166 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCCBP05166 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCCBP05166 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCCBP05166 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCCBP05166 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCCBP05166 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCCBP05166 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCCBP05166 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCCBP05166 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCCBP05166 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCCBP05166 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCCBP05166 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCCBP05166 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCCBP05166 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCCBP05166 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCCBP05166 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCCBP05166 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCCBP05166 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCCBP05166 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCCBP05166 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCCBP05166 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCCBP05166 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCCBP05166 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCCBP05166 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCCBP05166 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCCBP05166 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCCBP05166 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCCBP05166 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCCBP05166 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCCBP05166 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCCBP05166 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCCBP05166 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCCBP05166 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCCBP05166 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCCBP05166 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCCBP05166 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCCBP05166 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCCBP05166 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCCBP05166 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCCBP05166 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCCBP05166 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCCBP05166 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCCBP05166 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCCBP05166 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCCBP05166 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCCBP05166 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCCBP05166 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCCBP05166 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCCBP05166 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCCBP05166 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PCCBP05166 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCCBP05166 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCCBP05166 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCCBP05166 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCCBP05166 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCCBP05166 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCCBP05166 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCCBP05166 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCCBP05166 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCCBP05166 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCCBP05166 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCCBP05166 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCCBP05166 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PCCBP05166 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCCBP05166 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCCBP05166 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCCBP05166 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCCBP05166 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCCBP05166 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCCBP05166 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCCBP05166 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCCBP05166 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCCBP05166 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCCBP05166 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCCBP05166 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCCBP05166 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCCBP05166 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms