Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECM2O94769 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECM2O94769 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECM2O94769 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECM2O94769 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECM2O94769 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ECM2O94769 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECM2O94769 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ECM2O94769 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECM2O94769 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECM2O94769 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECM2O94769 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ECM2O94769 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECM2O94769 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ECM2O94769 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ECM2O94769 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ECM2O94769 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ECM2O94769 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ECM2O94769 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ECM2O94769 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ECM2O94769 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ECM2O94769 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ECM2O94769 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ECM2O94769 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECM2O94769 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECM2O94769 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECM2O94769 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECM2O94769 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECM2O94769 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECM2O94769 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECM2O94769 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECM2O94769 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECM2O94769 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECM2O94769 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECM2O94769 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECM2O94769 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECM2O94769 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECM2O94769 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECM2O94769 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECM2O94769 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ECM2O94769 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ECM2O94769 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ECM2O94769 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ECM2O94769 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ECM2O94769 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ECM2O94769 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ECM2O94769 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ECM2O94769 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ECM2O94769 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECM2O94769 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECM2O94769 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECM2O94769 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECM2O94769 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECM2O94769 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECM2O94769 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECM2O94769 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECM2O94769 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECM2O94769 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECM2O94769 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECM2O94769 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECM2O94769 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECM2O94769 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECM2O94769 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECM2O94769 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECM2O94769 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECM2O94769 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ECM2O94769 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECM2O94769 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ECM2O94769 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ECM2O94769 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ECM2O94769 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ECM2O94769 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECM2O94769 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECM2O94769 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECM2O94769 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECM2O94769 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECM2O94769 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECM2O94769 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECM2O94769 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECM2O94769 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECM2O94769 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECM2O94769 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ECM2O94769 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ECM2O94769 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ECM2O94769 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ECM2O94769 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECM2O94769 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECM2O94769 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECM2O94769 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECM2O94769 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECM2O94769 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECM2O94769 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECM2O94769 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECM2O94769 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ECM2O94769 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECM2O94769 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECM2O94769 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECM2O94769 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECM2O94769 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECM2O94769 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms