Protein–RNA interactions for Protein: O76050

NEURL1, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1O76050 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEURL1O76050 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEURL1O76050 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL1O76050 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEURL1O76050 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEURL1O76050 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEURL1O76050 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEURL1O76050 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEURL1O76050 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEURL1O76050 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEURL1O76050 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEURL1O76050 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEURL1O76050 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEURL1O76050 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEURL1O76050 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEURL1O76050 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEURL1O76050 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NEURL1O76050 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEURL1O76050 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEURL1O76050 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEURL1O76050 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEURL1O76050 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms