Protein–RNA interactions for Protein: O76050

NEURL1, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1O76050 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NEURL1O76050 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEURL1O76050 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEURL1O76050 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEURL1O76050 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEURL1O76050 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEURL1O76050 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NEURL1O76050 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEURL1O76050 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEURL1O76050 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEURL1O76050 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEURL1O76050 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEURL1O76050 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NEURL1O76050 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEURL1O76050 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEURL1O76050 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEURL1O76050 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEURL1O76050 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEURL1O76050 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NEURL1O76050 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEURL1O76050 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEURL1O76050 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEURL1O76050 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEURL1O76050 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEURL1O76050 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEURL1O76050 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEURL1O76050 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEURL1O76050 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEURL1O76050 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEURL1O76050 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL1O76050 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEURL1O76050 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEURL1O76050 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEURL1O76050 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEURL1O76050 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEURL1O76050 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEURL1O76050 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
NEURL1O76050 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEURL1O76050 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NEURL1O76050 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEURL1O76050 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEURL1O76050 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEURL1O76050 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NEURL1O76050 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEURL1O76050 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEURL1O76050 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NEURL1O76050 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEURL1O76050 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEURL1O76050 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEURL1O76050 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEURL1O76050 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEURL1O76050 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEURL1O76050 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEURL1O76050 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL1O76050 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NEURL1O76050 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEURL1O76050 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL1O76050 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEURL1O76050 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL1O76050 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL1O76050 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL1O76050 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEURL1O76050 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NEURL1O76050 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEURL1O76050 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEURL1O76050 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEURL1O76050 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEURL1O76050 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL1O76050 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEURL1O76050 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL1O76050 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL1O76050 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL1O76050 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL1O76050 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL1O76050 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL1O76050 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL1O76050 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NEURL1O76050 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEURL1O76050 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEURL1O76050 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEURL1O76050 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEURL1O76050 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEURL1O76050 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEURL1O76050 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEURL1O76050 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEURL1O76050 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEURL1O76050 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEURL1O76050 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEURL1O76050 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEURL1O76050 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEURL1O76050 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEURL1O76050 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NEURL1O76050 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEURL1O76050 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEURL1O76050 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEURL1O76050 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEURL1O76050 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEURL1O76050 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEURL1O76050 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEURL1O76050 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms