Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSDE1O75534 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CSDE1O75534 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms