Protein–RNA interactions for Protein: O14830

PPEF2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF2O14830 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPEF2O14830 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPEF2O14830 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPEF2O14830 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPEF2O14830 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPEF2O14830 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPEF2O14830 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPEF2O14830 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPEF2O14830 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PPEF2O14830 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPEF2O14830 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPEF2O14830 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPEF2O14830 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPEF2O14830 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPEF2O14830 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPEF2O14830 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPEF2O14830 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPEF2O14830 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPEF2O14830 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPEF2O14830 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPEF2O14830 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPEF2O14830 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPEF2O14830 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPEF2O14830 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPEF2O14830 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPEF2O14830 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPEF2O14830 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPEF2O14830 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPEF2O14830 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPEF2O14830 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPEF2O14830 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PPEF2O14830 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPEF2O14830 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPEF2O14830 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPEF2O14830 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPEF2O14830 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPEF2O14830 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPEF2O14830 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPEF2O14830 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms