Protein–RNA interactions for Protein: A6NDY0

PABPN1L, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1LA6NDY0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PABPN1LA6NDY0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PABPN1LA6NDY0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PABPN1LA6NDY0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PABPN1LA6NDY0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PABPN1LA6NDY0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PABPN1LA6NDY0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PABPN1LA6NDY0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PABPN1LA6NDY0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PABPN1LA6NDY0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PABPN1LA6NDY0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PABPN1LA6NDY0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PABPN1LA6NDY0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PABPN1LA6NDY0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PABPN1LA6NDY0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PABPN1LA6NDY0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms