Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 EXOSC7-207ENST00000481405 768 ntTSL 336.49■■■■□ 3.433e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 CLEC3B-203ENST00000490386 708 ntTSL 335.16■■■■□ 3.223e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.783e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 DPP7-212ENST00000491807 618 ntTSL 325.24■■□□□ 1.633e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.553e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.493e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 DPP7-207ENST00000473703 684 ntTSL 320.74■□□□□ 0.913e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.673e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.583e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 QARS-214ENST00000478561 670 ntTSL 318.21■□□□□ 0.513e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 KLF3-202ENST00000482150 517 ntTSL 217.14■□□□□ 0.333e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 EXOSC7-210ENST00000491476 1395 ntTSL 516.77■□□□□ 0.283e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 ATP1B3-205ENST00000475483 734 ntTSL 316.67■□□□□ 0.263e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.253e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 PSME1-208ENST00000561059 947 ntTSL 216.36■□□□□ 0.213e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 EXOSC7-203ENST00000461361 1593 ntTSL 216.18■□□□□ 0.183e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.153e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 EXOSC7-205ENST00000468667 831 ntTSL 515.42■□□□□ 0.063e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.053e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.043e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.093e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 PARL-209ENST00000469056 579 ntTSL 314.32□□□□□ -0.123e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 ZC3HC1-203ENST00000360708 1676 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.133e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 ZC3HC1-209ENST00000481503 1741 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.193e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 QARS-251ENST00000637543 2074 ntTSL 513.62□□□□□ -0.233e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 ZC3HC1-202ENST00000358303 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.253e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 ZC3HC1-201ENST00000311873 2017 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.293e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 ZC3HC1-204ENST00000467642 1934 ntTSL 211.78□□□□□ -0.523e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 QARS-228ENST00000634432 582 ntTSL 311.77□□□□□ -0.533e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 EXOSC7-209ENST00000486727 1647 ntTSL 211.54□□□□□ -0.563e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 BST2-202ENST00000527220 335 ntTSL 211.41□□□□□ -0.583e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 AC005307.1-201ENST00000567877 1570 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.663e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 EXOSC7-202ENST00000459856 434 ntTSL 38.9□□□□□ -0.983e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 FOPNL-206ENST00000573968 2039 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.013e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.153e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 QARS-219ENST00000482468 402 ntTSL 27.3□□□□□ -1.243e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.253e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 ATP1B3-206ENST00000482635 569 ntTSL 57.22□□□□□ -1.253e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.283e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.583e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 PARL-207ENST00000449306 476 ntTSL 54.57□□□□□ -1.683e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 SMAD5-208ENST00000513418 523 ntTSL 54.31□□□□□ -1.723e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 PSME1-203ENST00000470718 476 ntTSL 33.92□□□□□ -1.783e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.351e-14■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 PSMD14-205ENST00000492908 1786 ntTSL 25.46□□□□□ -1.541e-14■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 PSMD14-203ENST00000477232 4890 ntTSL 1 (best)2.51□□□□□ -2.011e-14■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 MFSD3-203ENST00000528047 1433 ntTSL 326.27■■□□□ 1.84e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.554e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 MFSD3-204ENST00000534427 849 ntTSL 220.82■□□□□ 0.924e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.614e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 U2SURP-203ENST00000463563 4364 ntTSL 23.23□□□□□ -1.894e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.835e-24■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.185e-24■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.392e-31■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 RPLP1-205ENST00000560274 256 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.832e-44■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 PVT1-224ENST00000616386 113 nt3.01□□□□□ -1.932e-10■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 RRP12-205ENST00000465394 652 ntTSL 520.14■□□□□ 0.814e-13■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 HDLBP-238ENST00000479894 840 ntTSL 519.34■□□□□ 0.694e-13■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 HDLBP-239ENST00000483086 620 ntTSL 314.52□□□□□ -0.094e-13■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.134e-13■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 HDLBP-232ENST00000470482 624 ntTSL 214.19□□□□□ -0.144e-13■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 SLC25A13-201ENST00000265631 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.84e-13■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 PSMD1-202ENST00000373635 3230 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.232e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 PSMD1-201ENST00000308696 3326 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.332e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 PSMD1-212ENST00000491229 546 ntTSL 25.44□□□□□ -1.542e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.562e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 ACTR2-201ENST00000260641 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.821e-8■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 RAB11A-204ENST00000565075 711 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.241e-7■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 RAB11A-208ENST00000569304 347 ntTSL 36.19□□□□□ -1.421e-7■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.751e-7■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.571e-7■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.742e-15■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.182e-15■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.692e-15■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 EED-204ENST00000524673 1155 ntTSL 38.26□□□□□ -1.092e-15■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 EED-208ENST00000528250 1235 ntTSL 27.63□□□□□ -1.192e-15■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.332e-15■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.542e-15■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 HMBS-226ENST00000640813 1283 ntTSL 522.54■■□□□ 1.21e-11■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 TNNT1-210ENST00000588147 489 ntTSL 1 (best)16.11■□□□□ 0.176e-10■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 TNNT1-215ENST00000592920 583 ntTSL 515.96■□□□□ 0.156e-10■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.662e-7■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 RCC1-204ENST00000398958 2715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.422e-7■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 RCC1-203ENST00000373833 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.552e-7■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.362e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.345e-16■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.045e-16■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 C19orf24-205ENST00000590269 751 ntTSL 321.33■■□□□ 1.012e-7■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.872e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.785e-16■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.745e-16■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.613e-8■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 SDHA-218ENST00000515752 1809 ntTSL 516.93■□□□□ 0.35e-16■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 SDHA-203ENST00000503674 2426 ntTSL 214.73□□□□□ -0.055e-16■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 SDHA-209ENST00000509082 434 ntTSL 514.57□□□□□ -0.085e-16■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 SDHA-211ENST00000509564 630 ntTSL 314.57□□□□□ -0.085e-16■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 SDHA-219ENST00000515815 704 ntTSL 314.57□□□□□ -0.085e-16■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 SDHA-208ENST00000507522 644 ntTSL 514.56□□□□□ -0.085e-16■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 SDHA-216ENST00000514027 2209 ntTSL 213.8□□□□□ -0.25e-16■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 SDHA-214ENST00000511810 3001 ntTSL 211.21□□□□□ -0.625e-16■■□□□ 14.4
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