RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536244.5

KCTD20-210, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 20, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene KCTD20, Length 5,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD20-210ENST00000536244 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.41■■■□□ 2.46
KCTD20-210ENST00000536244 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
KCTD20-210ENST00000536244 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
KCTD20-210ENST00000536244 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.47■■■□□ 2.15
KCTD20-210ENST00000536244 APLP2Q06481 763 aa28.41■■■□□ 2.14
KCTD20-210ENST00000536244 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.28■■■□□ 2.12
KCTD20-210ENST00000536244 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.12■■■□□ 2.09
KCTD20-210ENST00000536244 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
KCTD20-210ENST00000536244 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
KCTD20-210ENST00000536244 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.96■■■□□ 2.07
KCTD20-210ENST00000536244 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
KCTD20-210ENST00000536244 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
KCTD20-210ENST00000536244 MYT1Q01538 1121 aa27.87■■■□□ 2.05
KCTD20-210ENST00000536244 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.75■■■□□ 2.03
KCTD20-210ENST00000536244 NEFLP07196 543 aa27.4■■□□□ 1.98
KCTD20-210ENST00000536244 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
KCTD20-210ENST00000536244 TRIM41Q8WV44 630 aa27.2■■□□□ 1.95
KCTD20-210ENST00000536244 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
KCTD20-210ENST00000536244 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
KCTD20-210ENST00000536244 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
KCTD20-210ENST00000536244 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
KCTD20-210ENST00000536244 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
KCTD20-210ENST00000536244 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
KCTD20-210ENST00000536244 HRCP23327 699 aa26.51■■□□□ 1.83
KCTD20-210ENST00000536244 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
KCTD20-210ENST00000536244 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
KCTD20-210ENST00000536244 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.07■■□□□ 1.76
KCTD20-210ENST00000536244 ITGAEP38570 1179 aa26.01■■□□□ 1.75
KCTD20-210ENST00000536244 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
KCTD20-210ENST00000536244 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
KCTD20-210ENST00000536244 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
KCTD20-210ENST00000536244 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.9■■□□□ 1.74
KCTD20-210ENST00000536244 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
KCTD20-210ENST00000536244 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.86■■□□□ 1.73
KCTD20-210ENST00000536244 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.86■■□□□ 1.73
KCTD20-210ENST00000536244 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.76■■□□□ 1.71
KCTD20-210ENST00000536244 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
KCTD20-210ENST00000536244 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
KCTD20-210ENST00000536244 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
KCTD20-210ENST00000536244 ANP32CO43423 234 aa25.47■■□□□ 1.67
KCTD20-210ENST00000536244 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.44■■□□□ 1.66
KCTD20-210ENST00000536244 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
KCTD20-210ENST00000536244 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
KCTD20-210ENST00000536244 TRIM52Q96A61 297 aa25.37■■□□□ 1.65
KCTD20-210ENST00000536244 BCANQ96GW7 911 aa25.29■■□□□ 1.64
KCTD20-210ENST00000536244 NEUROD1Q13562 356 aa25.25■■□□□ 1.63
KCTD20-210ENST00000536244 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
KCTD20-210ENST00000536244 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
KCTD20-210ENST00000536244 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
KCTD20-210ENST00000536244 NEFMP07197 916 aa25.07■■□□□ 1.6
KCTD20-210ENST00000536244 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
KCTD20-210ENST00000536244 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
KCTD20-210ENST00000536244 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa24.83■■□□□ 1.57
KCTD20-210ENST00000536244 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
KCTD20-210ENST00000536244 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
KCTD20-210ENST00000536244 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
KCTD20-210ENST00000536244 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
KCTD20-210ENST00000536244 SLC24A1O60721 1099 aa24.69■■□□□ 1.54
KCTD20-210ENST00000536244 FKBP8Q14318 412 aa24.68■■□□□ 1.54
KCTD20-210ENST00000536244 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.66■■□□□ 1.54
KCTD20-210ENST00000536244 BCL11AQ9H165 835 aa24.61■■□□□ 1.53
KCTD20-210ENST00000536244 TONSLQ96HA7 1378 aa24.6■■□□□ 1.53
KCTD20-210ENST00000536244 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.52
KCTD20-210ENST00000536244 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
KCTD20-210ENST00000536244 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.46■■□□□ 1.51
KCTD20-210ENST00000536244 FBLN2P98095 1184 aa24.45■■□□□ 1.5
KCTD20-210ENST00000536244 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.43■■□□□ 1.5
KCTD20-210ENST00000536244 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.5
KCTD20-210ENST00000536244 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.37■■□□□ 1.49
KCTD20-210ENST00000536244 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
KCTD20-210ENST00000536244 P3H3Q8IVL6 736 aa24.37■■□□□ 1.49
KCTD20-210ENST00000536244 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
KCTD20-210ENST00000536244 TMC1Q8TDI8 760 aa24.35■■□□□ 1.49
KCTD20-210ENST00000536244 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.32■■□□□ 1.48
KCTD20-210ENST00000536244 ABCC9O60706 1549 aa24.27■■□□□ 1.48
KCTD20-210ENST00000536244 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.47
KCTD20-210ENST00000536244 NBR1Q14596 966 aa24.25■■□□□ 1.47
KCTD20-210ENST00000536244 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.25■■□□□ 1.47
KCTD20-210ENST00000536244 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
KCTD20-210ENST00000536244 MRS2Q9HD23 443 aa24.21■■□□□ 1.47
KCTD20-210ENST00000536244 ARID3CA6NKF2 412 aa24.2■■□□□ 1.46
KCTD20-210ENST00000536244 BECN1Q14457 450 aa24.19■■□□□ 1.46
KCTD20-210ENST00000536244 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.17■■□□□ 1.46
KCTD20-210ENST00000536244 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.16■■□□□ 1.46
KCTD20-210ENST00000536244 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
KCTD20-210ENST00000536244 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
KCTD20-210ENST00000536244 GOLGA6L22H0YM25 854 aa24.09■■□□□ 1.45
KCTD20-210ENST00000536244 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
KCTD20-210ENST00000536244 NCLP19338 710 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
KCTD20-210ENST00000536244 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
KCTD20-210ENST00000536244 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.44
KCTD20-210ENST00000536244 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
KCTD20-210ENST00000536244 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
KCTD20-210ENST00000536244 ARXQ96QS3 562 aa24■■□□□ 1.43
KCTD20-210ENST00000536244 TSPY4P0CV99 314 aa24■■□□□ 1.43
KCTD20-210ENST00000536244 TSPY10P0CW01 314 aa24■■□□□ 1.43
KCTD20-210ENST00000536244 MIER1Q8N108 512 aa23.99■■□□□ 1.43
KCTD20-210ENST00000536244 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
KCTD20-210ENST00000536244 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.95■■□□□ 1.42
KCTD20-210ENST00000536244 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms