RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469056.1

PARL-209, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

TSL 3

Gene PARL, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-209ENST00000469056 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.18■■■□□ 2.26
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PARL-209ENST00000469056 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.54■■□□□ 1.52
PARL-209ENST00000469056 NACADO15069 1562 aa24.49■■□□□ 1.51
PARL-209ENST00000469056 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.4■■□□□ 1.5
PARL-209ENST00000469056 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.31■■□□□ 1.48
PARL-209ENST00000469056 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PARL-209ENST00000469056 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.15■■□□□ 1.46
PARL-209ENST00000469056 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.96■■□□□ 1.43
PARL-209ENST00000469056 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.83■■□□□ 1.41
PARL-209ENST00000469056 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.78■■□□□ 1.4
PARL-209ENST00000469056 SCRIBQ14160 1630 aa23.71■■□□□ 1.39
PARL-209ENST00000469056 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.57■■□□□ 1.36
PARL-209ENST00000469056 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.51■■□□□ 1.35
PARL-209ENST00000469056 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
PARL-209ENST00000469056 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.11■■□□□ 1.29
PARL-209ENST00000469056 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.98■■□□□ 1.27
PARL-209ENST00000469056 SMARCA4P51532 1647 aa22.68■■□□□ 1.22
PARL-209ENST00000469056 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
PARL-209ENST00000469056 NCAPD3P42695 1498 aa22.58■■□□□ 1.2
PARL-209ENST00000469056 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.58■■□□□ 1.2
PARL-209ENST00000469056 SMARCA2P51531 1590 aa22.56■■□□□ 1.2
PARL-209ENST00000469056 HMGXB3Q12766 1538 aa22.48■■□□□ 1.19
PARL-209ENST00000469056 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.47■■□□□ 1.19
PARL-209ENST00000469056 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.46■■□□□ 1.19
PARL-209ENST00000469056 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PARL-209ENST00000469056 WIZO95785 1651 aa22.23■■□□□ 1.15
PARL-209ENST00000469056 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PARL-209ENST00000469056 ERCC6Q03468 1493 aa22.06■■□□□ 1.12
PARL-209ENST00000469056 NESP48681 1621 aa22.06■■□□□ 1.12
PARL-209ENST00000469056 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.03■■□□□ 1.12
PARL-209ENST00000469056 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PARL-209ENST00000469056 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.92■■□□□ 1.1
PARL-209ENST00000469056 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.88■■□□□ 1.09
PARL-209ENST00000469056 CUX2O14529 1486 aa21.87■■□□□ 1.09
PARL-209ENST00000469056 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PARL-209ENST00000469056 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.82■■□□□ 1.08
PARL-209ENST00000469056 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PARL-209ENST00000469056 CFTRP13569 1480 aa21.77■■□□□ 1.07
PARL-209ENST00000469056 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.72■■□□□ 1.07
PARL-209ENST00000469056 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.67■■□□□ 1.06
PARL-209ENST00000469056 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.67■■□□□ 1.06
PARL-209ENST00000469056 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.66■■□□□ 1.06
PARL-209ENST00000469056 PRDM2Q13029 1718 aa21.61■■□□□ 1.05
PARL-209ENST00000469056 WDR62O43379 1518 aa21.6■■□□□ 1.05
PARL-209ENST00000469056 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PARL-209ENST00000469056 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PARL-209ENST00000469056 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.43■■□□□ 1.02
PARL-209ENST00000469056 ABCC8Q09428 1581 aa21.32■■□□□ 1
PARL-209ENST00000469056 TOPBP1Q92547 1522 aa21.31■■□□□ 1
PARL-209ENST00000469056 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.29■■□□□ 1
PARL-209ENST00000469056 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.29■■□□□ 1
PARL-209ENST00000469056 IFT140Q96RY7 1462 aa21.22■□□□□ 0.99
PARL-209ENST00000469056 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PARL-209ENST00000469056 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PARL-209ENST00000469056 CUX1P39880 1505 aa21.1■□□□□ 0.97
PARL-209ENST00000469056 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
PARL-209ENST00000469056 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.06■□□□□ 0.96
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PARL-209ENST00000469056 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.01■□□□□ 0.95
PARL-209ENST00000469056 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.97■□□□□ 0.95
PARL-209ENST00000469056 WDR97A6NE52 1622 aa20.95■□□□□ 0.94
PARL-209ENST00000469056 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.93■□□□□ 0.94
PARL-209ENST00000469056 OSCARQ8IYS5 282 aa20.91■□□□□ 0.94
PARL-209ENST00000469056 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
PARL-209ENST00000469056 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.9■□□□□ 0.94
PARL-209ENST00000469056 TOP2BQ02880 1626 aa20.89■□□□□ 0.94
PARL-209ENST00000469056 SYNJ1O43426 1573 aa20.87■□□□□ 0.93
PARL-209ENST00000469056 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.85■□□□□ 0.93
PARL-209ENST00000469056 GRIN2BQ13224 1484 aa20.81■□□□□ 0.92
PARL-209ENST00000469056 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.81■□□□□ 0.92
PARL-209ENST00000469056 CHD1O14646 1710 aa20.79■□□□□ 0.92
PARL-209ENST00000469056 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.79■□□□□ 0.92
PARL-209ENST00000469056 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.78■□□□□ 0.92
PARL-209ENST00000469056 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
PARL-209ENST00000469056 PBRM1Q86U86 1689 aa20.77■□□□□ 0.91
PARL-209ENST00000469056 FBLN2P98095 1184 aa20.75■□□□□ 0.91
PARL-209ENST00000469056 SYNJ2O15056 1496 aa20.69■□□□□ 0.9
PARL-209ENST00000469056 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
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PARL-209ENST00000469056 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.6■□□□□ 0.89
PARL-209ENST00000469056 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.6■□□□□ 0.89
PARL-209ENST00000469056 ADAMTS12P58397 1594 aa20.6■□□□□ 0.89
PARL-209ENST00000469056 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.6■□□□□ 0.89
PARL-209ENST00000469056 ARHGEF11O15085 1522 aa20.59■□□□□ 0.89
PARL-209ENST00000469056 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.57■□□□□ 0.88
PARL-209ENST00000469056 TRIM41Q8WV44 630 aa20.56■□□□□ 0.88
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PARL-209ENST00000469056 NUP160Q12769 1436 aa20.45■□□□□ 0.86
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PARL-209ENST00000469056 IGF1RP08069 1367 aa20.41■□□□□ 0.86
PARL-209ENST00000469056 ARAP1Q96P48 1450 aa20.41■□□□□ 0.86
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PARL-209ENST00000469056 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.38■□□□□ 0.85
PARL-209ENST00000469056 SHROOM2Q13796 1616 aa20.31■□□□□ 0.84
PARL-209ENST00000469056 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.3■□□□□ 0.84
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