Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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CASQ1P31415 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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CASQ1P31415 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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CASQ1P31415 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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CASQ1P31415 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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CASQ1P31415 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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CASQ1P31415 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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CASQ1P31415 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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CASQ1P31415 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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CASQ1P31415 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASQ1P31415 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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