RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353437.10

GABRB2-202, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GABRB2, Length 1,963 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2-202ENST00000353437 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.2■■■■□ 3.87
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GABRB2-202ENST00000353437 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.58■■■□□ 2.81
GABRB2-202ENST00000353437 ABCC9O60706 1549 aa32.46■■■□□ 2.79
GABRB2-202ENST00000353437 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.29■■■□□ 2.76
GABRB2-202ENST00000353437 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.16■■■□□ 2.74
GABRB2-202ENST00000353437 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.88■■■□□ 2.69
GABRB2-202ENST00000353437 NACADO15069 1562 aa31.76■■■□□ 2.67
GABRB2-202ENST00000353437 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.5■■■□□ 2.63
GABRB2-202ENST00000353437 SCRIBQ14160 1630 aa31.49■■■□□ 2.63
GABRB2-202ENST00000353437 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.99■■■□□ 2.55
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GABRB2-202ENST00000353437 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
GABRB2-202ENST00000353437 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.36■■■□□ 2.45
GABRB2-202ENST00000353437 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.42
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GABRB2-202ENST00000353437 WIZO95785 1651 aa30.11■■■□□ 2.41
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GABRB2-202ENST00000353437 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.69■■■□□ 2.34
GABRB2-202ENST00000353437 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
GABRB2-202ENST00000353437 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.67■■■□□ 2.34
GABRB2-202ENST00000353437 SMARCA2P51531 1590 aa29.55■■■□□ 2.32
GABRB2-202ENST00000353437 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.55■■■□□ 2.32
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GABRB2-202ENST00000353437 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.31■■■□□ 2.28
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GABRB2-202ENST00000353437 ABCC8Q09428 1581 aa28.89■■■□□ 2.22
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GABRB2-202ENST00000353437 CFTRP13569 1480 aa28.73■■■□□ 2.19
GABRB2-202ENST00000353437 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.66■■■□□ 2.18
GABRB2-202ENST00000353437 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.62■■■□□ 2.17
GABRB2-202ENST00000353437 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
GABRB2-202ENST00000353437 SYNJ1O43426 1573 aa28.54■■■□□ 2.16
GABRB2-202ENST00000353437 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.53■■■□□ 2.16
GABRB2-202ENST00000353437 NESP48681 1621 aa28.53■■■□□ 2.16
GABRB2-202ENST00000353437 PRDM2Q13029 1718 aa28.48■■■□□ 2.15
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GABRB2-202ENST00000353437 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.34■■■□□ 2.13
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GABRB2-202ENST00000353437 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.12■■■□□ 2.09
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GABRB2-202ENST00000353437 ADAMTS12P58397 1594 aa27.14■■□□□ 1.94
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GABRB2-202ENST00000353437 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.13■■□□□ 1.93
GABRB2-202ENST00000353437 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.12■■□□□ 1.93
GABRB2-202ENST00000353437 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.11■■□□□ 1.93
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