Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CASQ1P31415 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CASQ1P31415 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CASQ1P31415 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CASQ1P31415 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CASQ1P31415 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CASQ1P31415 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CASQ1P31415 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CASQ1P31415 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CASQ1P31415 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
CASQ1P31415 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CASQ1P31415 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CASQ1P31415 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CASQ1P31415 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CASQ1P31415 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CASQ1P31415 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CASQ1P31415 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CASQ1P31415 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CASQ1P31415 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CASQ1P31415 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CASQ1P31415 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CASQ1P31415 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CASQ1P31415 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CASQ1P31415 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CASQ1P31415 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CASQ1P31415 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CASQ1P31415 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CASQ1P31415 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CASQ1P31415 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CASQ1P31415 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CASQ1P31415 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CASQ1P31415 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CASQ1P31415 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CASQ1P31415 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CASQ1P31415 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CASQ1P31415 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CASQ1P31415 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CASQ1P31415 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CASQ1P31415 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CASQ1P31415 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CASQ1P31415 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CASQ1P31415 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CASQ1P31415 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CASQ1P31415 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CASQ1P31415 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CASQ1P31415 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CASQ1P31415 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CASQ1P31415 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CASQ1P31415 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CASQ1P31415 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CASQ1P31415 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CASQ1P31415 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CASQ1P31415 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CASQ1P31415 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CASQ1P31415 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CASQ1P31415 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CASQ1P31415 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CASQ1P31415 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CASQ1P31415 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CASQ1P31415 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CASQ1P31415 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CASQ1P31415 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CASQ1P31415 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CASQ1P31415 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CASQ1P31415 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CASQ1P31415 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CASQ1P31415 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CASQ1P31415 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CASQ1P31415 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CASQ1P31415 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CASQ1P31415 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CASQ1P31415 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CASQ1P31415 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CASQ1P31415 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CASQ1P31415 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CASQ1P31415 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CASQ1P31415 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CASQ1P31415 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CASQ1P31415 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CASQ1P31415 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CASQ1P31415 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CASQ1P31415 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CASQ1P31415 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CASQ1P31415 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CASQ1P31415 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CASQ1P31415 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CASQ1P31415 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CASQ1P31415 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CASQ1P31415 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CASQ1P31415 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CASQ1P31415 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CASQ1P31415 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CASQ1P31415 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CASQ1P31415 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CASQ1P31415 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CASQ1P31415 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CASQ1P31415 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CASQ1P31415 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CASQ1P31415 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CASQ1P31415 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms