Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VIL1P09327 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VIL1P09327 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VIL1P09327 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VIL1P09327 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VIL1P09327 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VIL1P09327 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VIL1P09327 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VIL1P09327 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VIL1P09327 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VIL1P09327 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VIL1P09327 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VIL1P09327 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VIL1P09327 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VIL1P09327 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VIL1P09327 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VIL1P09327 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIL1P09327 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIL1P09327 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VIL1P09327 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIL1P09327 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIL1P09327 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIL1P09327 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VIL1P09327 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VIL1P09327 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIL1P09327 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VIL1P09327 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIL1P09327 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIL1P09327 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIL1P09327 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VIL1P09327 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIL1P09327 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VIL1P09327 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIL1P09327 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VIL1P09327 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIL1P09327 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIL1P09327 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIL1P09327 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIL1P09327 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIL1P09327 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIL1P09327 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VIL1P09327 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIL1P09327 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIL1P09327 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIL1P09327 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIL1P09327 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIL1P09327 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIL1P09327 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIL1P09327 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VIL1P09327 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VIL1P09327 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIL1P09327 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIL1P09327 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIL1P09327 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VIL1P09327 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIL1P09327 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIL1P09327 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIL1P09327 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIL1P09327 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIL1P09327 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIL1P09327 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIL1P09327 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIL1P09327 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIL1P09327 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIL1P09327 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIL1P09327 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VIL1P09327 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIL1P09327 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIL1P09327 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIL1P09327 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIL1P09327 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIL1P09327 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIL1P09327 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VIL1P09327 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms