Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC42.15■■■■■ 4.34
VIL1P09327 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
VIL1P09327 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
VIL1P09327 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
VIL1P09327 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
VIL1P09327 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
VIL1P09327 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
VIL1P09327 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
VIL1P09327 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
VIL1P09327 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
VIL1P09327 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
VIL1P09327 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.93
VIL1P09327 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
VIL1P09327 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
VIL1P09327 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
VIL1P09327 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
VIL1P09327 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
VIL1P09327 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
VIL1P09327 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
VIL1P09327 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
VIL1P09327 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
VIL1P09327 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
VIL1P09327 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
VIL1P09327 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
VIL1P09327 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
VIL1P09327 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
VIL1P09327 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
VIL1P09327 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
VIL1P09327 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
VIL1P09327 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
VIL1P09327 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
VIL1P09327 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
VIL1P09327 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
VIL1P09327 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
VIL1P09327 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
VIL1P09327 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
VIL1P09327 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
VIL1P09327 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
VIL1P09327 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
VIL1P09327 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
VIL1P09327 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
VIL1P09327 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
VIL1P09327 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
VIL1P09327 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
VIL1P09327 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
VIL1P09327 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
VIL1P09327 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
VIL1P09327 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
VIL1P09327 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
VIL1P09327 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
VIL1P09327 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
VIL1P09327 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
VIL1P09327 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
VIL1P09327 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
VIL1P09327 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
VIL1P09327 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
VIL1P09327 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
VIL1P09327 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
VIL1P09327 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
VIL1P09327 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
VIL1P09327 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
VIL1P09327 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
VIL1P09327 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
VIL1P09327 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
VIL1P09327 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
VIL1P09327 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
VIL1P09327 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
VIL1P09327 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
VIL1P09327 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
VIL1P09327 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
VIL1P09327 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
VIL1P09327 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
VIL1P09327 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
VIL1P09327 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
VIL1P09327 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
VIL1P09327 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
VIL1P09327 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
VIL1P09327 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
VIL1P09327 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
VIL1P09327 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
VIL1P09327 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
VIL1P09327 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
VIL1P09327 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
VIL1P09327 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
VIL1P09327 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
VIL1P09327 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
VIL1P09327 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
VIL1P09327 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
VIL1P09327 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
VIL1P09327 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
VIL1P09327 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
VIL1P09327 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
VIL1P09327 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
VIL1P09327 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
VIL1P09327 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
VIL1P09327 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
VIL1P09327 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
VIL1P09327 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
VIL1P09327 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
VIL1P09327 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms