Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 RPL9-211ENST00000514842 2153 ntTSL 512.36□□□□□ -0.434e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CYB5A-201ENST00000299438 718 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GINS4-209ENST00000523277 3873 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 VPS72-205ENST00000491094 4267 ntTSL 512.29□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RAPGEF1-207ENST00000481260 1034 ntTSL 512.29□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ANO5-201ENST00000324559 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 149.1
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UTP3Q9NQZ2 CMTM1-216ENST00000533078 565 ntTSL 1 (best)12.26□□□□□ -0.459e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CMTM1-215ENST00000531885 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.459e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CMTM1-206ENST00000457188 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.459e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TXNDC15-207ENST00000508779 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.25□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NEIL1-201ENST00000355059 3759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 IL20RB-201ENST00000329582 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.459e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 POU2F1-209ENST00000470928 858 ntTSL 512.23□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF3-207ENST00000473779 669 ntTSL 312.22□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF3-211ENST00000486829 428 ntTSL 312.22□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 POMGNT1-202ENST00000371992 2934 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FBXW2-204ENST00000493559 2154 ntTSL 212.19□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CECR7-203ENST00000609596 2283 ntTSL 512.19□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 LOXL3-201ENST00000264094 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AC116366.2-201ENST00000454380 767 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PRPSAP2-203ENST00000412418 968 ntTSL 512.16□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FRAS1-201ENST00000325942 7142 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SCN10A-201ENST00000449082 6418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MYO1F-201ENST00000338257 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SKAP2-209ENST00000497511 585 ntTSL 412.1□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF300-205ENST00000446148 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GAS7-208ENST00000578655 603 ntTSL 412.08□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 VPS18-201ENST00000220509 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ERLIN2-204ENST00000518526 663 ntTSL 312.04□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TXNDC15-201ENST00000358387 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PHF20-202ENST00000374000 1814 ntTSL 1 (best)12.02□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NUP37-207ENST00000551200 1158 ntTSL 1 (best)12□□□□□ -0.492e-22■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DRC3-212ENST00000581264 551 ntTSL 412□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 E2F4-212ENST00000568839 944 ntTSL 311.99□□□□□ -0.499e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 THUMPD3-AS1-203ENST00000469846 670 ntTSL 311.99□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 BZW2-211ENST00000446596 859 ntTSL 311.98□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RCL1-203ENST00000381732 804 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.495e-8■■■■■ 149.1
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UTP3Q9NQZ2 KIF1B-213ENST00000635499 2098 ntTSL 511.95□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FBXL19-AS1-201ENST00000563777 3951 ntBASIC11.94□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF263-201ENST00000219069 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.59e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TFAP4-203ENST00000573476 785 ntTSL 311.91□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TFAP4-204ENST00000574639 595 ntTSL 511.89□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AC005537.1-204ENST00000609382 813 ntTSL 511.87□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 QARS-209ENST00000464962 2362 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CTSC-206ENST00000529974 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 USP28-201ENST00000003302 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TXNDC15-206ENST00000507024 2893 ntTSL 1 (best)11.84□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NEIL1-202ENST00000561643 3271 ntTSL 511.82□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AL356599.1-211ENST00000630919 432 ntTSL 511.79□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GIGYF2-206ENST00000410033 957 ntTSL 411.78□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RRP1B-202ENST00000470886 4634 ntTSL 211.78□□□□□ -0.529e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 OSBPL5-211ENST00000526122 554 ntTSL 411.77□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GAS7-207ENST00000578599 556 ntTSL 211.75□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GIGYF2-224ENST00000458528 566 ntTSL 411.74□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 EHMT1-245ENST00000637662 89 ntTSL 511.74□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 WSCD2-207ENST00000549903 3534 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PDE11A-201ENST00000286063 9275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 VLDLR-203ENST00000382100 9163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CFAP97-202ENST00000458385 4852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 EHMT1-230ENST00000636186 100 ntTSL 511.69□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MIATNB-203ENST00000435162 760 ntTSL 211.64□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ERLIN2-203ENST00000397228 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 USP54-201ENST00000339859 6247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF300-202ENST00000394226 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 QARS-247ENST00000636018 2171 ntTSL 511.59□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CUL9-202ENST00000372647 7684 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.564e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 C2CD2-203ENST00000449165 4559 ntTSL 1 (best)11.56□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 POMGNT1-203ENST00000396420 3480 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TMC8-202ENST00000589691 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 LMBR1L-229ENST00000553040 768 ntTSL 511.51□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ERLIN2-206ENST00000519638 1718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DPEP2-209ENST00000575510 447 ntTSL 311.5□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 STK10-204ENST00000517524 909 ntTSL 311.49□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ASPSCR1-215ENST00000583142 532 ntTSL 311.49□□□□□ -0.574e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DYNC1I2-205ENST00000409453 2552 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.579e-9■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MRVI1-217ENST00000558540 3339 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PAH-215ENST00000553106 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 OGDHL-203ENST00000432695 3383 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MTMR7-202ENST00000517317 739 ntTSL 511.43□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RAD54L2-201ENST00000409535 9776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PARP14-202ENST00000474629 7915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DNAJA3-206ENST00000572139 578 ntTSL 411.39□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FCHO1-209ENST00000595549 774 ntTSL 511.39□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TTC27-205ENST00000448773 509 ntTSL 411.38□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 LINC00623-203ENST00000615424 590 ntTSL 1 (best)11.38□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AL356599.1-205ENST00000606388 3961 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PUF60-213ENST00000528999 431 ntTSL 311.37□□□□□ -0.599e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GMDS-AS1-216ENST00000607519 579 ntTSL 411.37□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CTSC-207ENST00000533865 542 ntTSL 411.37□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MYO1F-209ENST00000596675 531 ntTSL 511.36□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 KCNMB3-207ENST00000497599 1004 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.591e-8■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PTK2-256ENST00000524257 430 ntTSL 411.36□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF3-201ENST00000296315 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ATAD1-201ENST00000308448 4640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.591e-8■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TGFBR3-205ENST00000468996 569 ntTSL 411.34□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PRPSAP2-222ENST00000574451 1019 ntTSL 311.32□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 APOO-201ENST00000379226 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 149.1
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