RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607519.1

GMDS-AS1-216, humanhuman

TSL 4

Gene GMDS-AS1, Length 579 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NISCHQ9Y2I1 1504 aa24.93■■□□□ 1.58
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.91■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ABCC9O60706 1549 aa21.41■■□□□ 1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DCAF8L2P0C7V8 631 aa20.94■□□□□ 0.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NACADO15069 1562 aa20.59■□□□□ 0.89
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.55■□□□□ 0.88
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa20.53■□□□□ 0.88
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MYO15BQ96JP2 1530 aa20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SCRIBQ14160 1630 aa20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-216ENST00000607519 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.17■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa20.07■□□□□ 0.8
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.02■□□□□ 0.8
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.56■□□□□ 0.72
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CECR2Q9BXF3 1484 aa19.51■□□□□ 0.71
GMDS-AS1-216ENST00000607519 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.32■□□□□ 0.68
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MROH2BQ7Z745 1585 aa19.29■□□□□ 0.68
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SMARCA4P51532 1647 aa19.27■□□□□ 0.68
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.14■□□□□ 0.65
GMDS-AS1-216ENST00000607519 WIZO95785 1651 aa19.1■□□□□ 0.65
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NCAPD3P42695 1498 aa19.04■□□□□ 0.64
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SMARCA2P51531 1590 aa19.03■□□□□ 0.64
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.01■□□□□ 0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HMGXB3Q12766 1538 aa18.9■□□□□ 0.62
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CCDC88BA6NC98 1476 aa18.69■□□□□ 0.58
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NESP48681 1621 aa18.63■□□□□ 0.57
GMDS-AS1-216ENST00000607519 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CADPSQ9ULU8 1353 aa18.55■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CFTRP13569 1480 aa18.46■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa18.44■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ERCC6Q03468 1493 aa18.35■□□□□ 0.53
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.35■□□□□ 0.53
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.33■□□□□ 0.52
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FANCD2Q9BXW9 1451 aa18.33■□□□□ 0.52
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PRDM2Q13029 1718 aa18.26■□□□□ 0.51
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CEP164Q9UPV0 1460 aa18.23■□□□□ 0.51
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.19■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MRC2Q9UBG0 1479 aa18.16■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-216ENST00000607519 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-216ENST00000607519 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ABCC8Q09428 1581 aa18.11■□□□□ 0.49
GMDS-AS1-216ENST00000607519 WDR62O43379 1518 aa18.07■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TOPBP1Q92547 1522 aa18.07■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CUX1P39880 1505 aa18.06■□□□□ 0.48
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.01■□□□□ 0.47
GMDS-AS1-216ENST00000607519 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.01■□□□□ 0.47
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CUX2O14529 1486 aa17.98■□□□□ 0.47
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SYNJ1O43426 1573 aa17.98■□□□□ 0.47
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FGD5Q6ZNL6 1462 aa17.94■□□□□ 0.46
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa17.94■□□□□ 0.46
GMDS-AS1-216ENST00000607519 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TOP2BQ02880 1626 aa17.9■□□□□ 0.46
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SOGA1O94964 1423 aa17.89■□□□□ 0.46
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.88■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TRIM41Q8WV44 630 aa17.87■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IFT140Q96RY7 1462 aa17.83■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-216ENST00000607519 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.8■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa17.73■□□□□ 0.43
GMDS-AS1-216ENST00000607519 WDR97A6NE52 1622 aa17.7■□□□□ 0.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa17.68■□□□□ 0.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GAPVD1Q14C86 1478 aa17.66■□□□□ 0.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa17.61■□□□□ 0.41
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GRIN2BQ13224 1484 aa17.59■□□□□ 0.41
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KIF27Q86VH2 1401 aa17.59■□□□□ 0.41
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IGF1RP08069 1367 aa17.58■□□□□ 0.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FBLN2P98095 1184 aa17.57■□□□□ 0.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa17.56■□□□□ 0.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PBRM1Q86U86 1689 aa17.56■□□□□ 0.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ERICH3Q5RHP9 1530 aa17.48■□□□□ 0.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.47■□□□□ 0.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa17.45■□□□□ 0.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CHD1O14646 1710 aa17.45■□□□□ 0.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.45■□□□□ 0.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ADAMTS12P58397 1594 aa17.45■□□□□ 0.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FHAD1B1AJZ9 1412 aa17.44■□□□□ 0.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SYNJ2O15056 1496 aa17.43■□□□□ 0.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OSCARQ8IYS5 282 aa17.42■□□□□ 0.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GRIN2AQ12879 1464 aa17.37■□□□□ 0.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 EEA1Q15075 1411 aa17.36■□□□□ 0.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CUL7Q14999 1698 aa17.36■□□□□ 0.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PRXQ9BXM0 1461 aa17.34■□□□□ 0.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa17.32■□□□□ 0.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CEP170Q5SW79 1584 aa17.3■□□□□ 0.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa17.28■□□□□ 0.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NUP160Q12769 1436 aa17.28■□□□□ 0.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms