Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 FNBP4-207ENST00000528388 814 ntTSL 23.6□□□□□ -1.832e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ITGB1-206ENST00000437302 445 ntTSL 52.98□□□□□ -1.932e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 INO80C-211ENST00000591139 408 ntTSL 51.65□□□□□ -2.152e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ITGB1-213ENST00000484088 580 ntTSL 41.54□□□□□ -2.162e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.362e-15■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 HMGCS1-202ENST00000433297 3466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.572e-15■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 EPS8-214ENST00000544064 577 ntTSL 421.08■□□□□ 0.975e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 EPS8-205ENST00000536793 559 ntTSL 417.9■□□□□ 0.465e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.265e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 EPS8-206ENST00000536956 621 ntTSL 316.08■□□□□ 0.165e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 EPS8-211ENST00000543468 3722 ntTSL 1 (best)12.53□□□□□ -0.45e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 EPS8-212ENST00000543523 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.495e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 EPS8-204ENST00000535752 543 ntTSL 44.19□□□□□ -1.745e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 EPS8-210ENST00000543363 374 ntTSL 42.72□□□□□ -1.975e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NCOR2-212ENST00000448008 735 ntTSL 513.67□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NCOR2-224ENST00000542927 828 ntTSL 312.22□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CIZ1-209ENST00000420484 684 ntTSL 328.89■■■□□ 2.227e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.177e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MVK-205ENST00000537237 1296 ntTSL 528.29■■■□□ 2.127e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.077e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AFDN-209ENST00000400825 963 ntTSL 527.46■■□□□ 1.997e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.967e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NEK6-209ENST00000444973 790 ntTSL 527.31■■□□□ 1.967e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.899e-7■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.787e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.697e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MVK-203ENST00000447878 1644 ntTSL 225.6■■□□□ 1.697e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.687e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.667e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AFDN-208ENST00000400824 875 ntTSL 525.38■■□□□ 1.657e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TTC3-223ENST00000492275 769 ntTSL 325.34■■□□□ 1.657e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KDSR-210ENST00000590056 462 ntTSL 325.33■■□□□ 1.657e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.627e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.67e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.537e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.537e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 VEGFA-220ENST00000519767 970 ntTSL 1 (best)24.6■■□□□ 1.537e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.537e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.537e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.537e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.537e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.537e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.537e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.537e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.537e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NEK6-211ENST00000454453 732 ntTSL 324.57■■□□□ 1.527e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.527e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ASPHD1-205ENST00000566693 1732 ntTSL 1 (best)24.39■■□□□ 1.57e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.497e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.487e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.479e-7■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.467e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SEMA4B-206ENST00000558895 533 ntTSL 424.14■■□□□ 1.457e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NME4-209ENST00000460297 1652 ntTSL 524.08■■□□□ 1.447e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SBF2-AS1-205ENST00000527406 666 ntTSL 424.01■■□□□ 1.437e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.437e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.417e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.417e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 HAGH-211ENST00000569339 820 ntTSL 323.82■■□□□ 1.47e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.397e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.397e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TPCN1-222ENST00000552897 596 ntTSL 423.71■■□□□ 1.397e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ASPHD1-202ENST00000414952 1451 ntTSL 223.64■■□□□ 1.387e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.367e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.52■■□□□ 1.367e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ANKS3-207ENST00000586605 968 ntTSL 523.52■■□□□ 1.367e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ANKS3-226ENST00000592698 1128 ntTSL 523.52■■□□□ 1.367e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.357e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TTC3-212ENST00000463216 842 ntTSL 523.28■■□□□ 1.327e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ANKS3-206ENST00000586166 672 ntTSL 323.19■■□□□ 1.37e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TTC3-224ENST00000494243 861 ntTSL 523.07■■□□□ 1.287e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AC093323.1-203ENST00000444232 1605 ntTSL 1 (best)22.87■■□□□ 1.257e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ANKS3-217ENST00000590730 2198 ntTSL 222.84■■□□□ 1.257e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.241e-10■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ANKS3-205ENST00000586159 868 ntTSL 322.71■■□□□ 1.237e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SEMA4B-218ENST00000561085 582 ntTSL 422.68■■□□□ 1.227e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NME4-204ENST00000433358 966 ntTSL 322.62■■□□□ 1.217e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.217e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.217e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PEMT-208ENST00000472446 473 ntTSL 322.53■■□□□ 1.27e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PDE9A-214ENST00000460905 715 ntTSL 522.46■■□□□ 1.197e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SSBP4-205ENST00000598159 747 ntTSL 322.4■■□□□ 1.189e-7■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.177e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.177e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.177e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BCAP31-206ENST00000442093 793 ntTSL 222.34■■□□□ 1.177e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PEMT-207ENST00000461404 591 ntTSL 522.28■■□□□ 1.167e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TIMM44-208ENST00000598968 797 ntTSL 322.23■■□□□ 1.157e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RBM7-206ENST00000544313 712 ntTSL 322.17■■□□□ 1.147e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NME4-206ENST00000448828 1167 ntTSL 222.15■■□□□ 1.147e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ACSS2-216ENST00000484354 517 ntTSL 522.1■■□□□ 1.137e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.137e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.137e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.131e-10■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.127e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SSBP4-209ENST00000601357 606 ntTSL 521.98■■□□□ 1.119e-7■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.17e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CIZ1-211ENST00000467178 904 ntTSL 321.92■■□□□ 1.17e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PEMT-212ENST00000580147 708 ntTSL 321.9■■□□□ 1.17e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.097e-6■■■■■ 27.5
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 215.7 ms