RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598968.5

TIMM44-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, humanhuman

TSL 3

Gene TIMM44, Length 797 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44-208ENST00000598968 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.82■■■■■ 6.37
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TIMM44-208ENST00000598968 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.03■■■■■ 4.96
TIMM44-208ENST00000598968 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.95■■■■■ 4.95
TIMM44-208ENST00000598968 NACADO15069 1562 aa45.86■■■■■ 4.93
TIMM44-208ENST00000598968 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.62■■■■■ 4.89
TIMM44-208ENST00000598968 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.5■■■■■ 4.87
TIMM44-208ENST00000598968 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.3■■■■■ 4.84
TIMM44-208ENST00000598968 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.89■■■■■ 4.78
TIMM44-208ENST00000598968 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.73■■■■■ 4.75
TIMM44-208ENST00000598968 SCRIBQ14160 1630 aa44.53■■■■■ 4.72
TIMM44-208ENST00000598968 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.51■■■■■ 4.72
TIMM44-208ENST00000598968 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44■■■■■ 4.63
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TIMM44-208ENST00000598968 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.23■■■■■ 4.51
TIMM44-208ENST00000598968 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.95■■■■■ 4.47
TIMM44-208ENST00000598968 SMARCA4P51532 1647 aa42.55■■■■■ 4.4
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TIMM44-208ENST00000598968 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.34■■■■■ 4.37
TIMM44-208ENST00000598968 NCAPD3P42695 1498 aa42.3■■■■■ 4.36
TIMM44-208ENST00000598968 SMARCA2P51531 1590 aa42.29■■■■■ 4.36
TIMM44-208ENST00000598968 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.27■■■■■ 4.36
TIMM44-208ENST00000598968 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.08■■■■■ 4.33
TIMM44-208ENST00000598968 HMGXB3Q12766 1538 aa42.07■■■■■ 4.33
TIMM44-208ENST00000598968 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
TIMM44-208ENST00000598968 WIZO95785 1651 aa41.84■■■■■ 4.29
TIMM44-208ENST00000598968 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
TIMM44-208ENST00000598968 NESP48681 1621 aa41.35■■■■■ 4.21
TIMM44-208ENST00000598968 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
TIMM44-208ENST00000598968 ERCC6Q03468 1493 aa41.25■■■■■ 4.19
TIMM44-208ENST00000598968 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.21■■■■■ 4.19
TIMM44-208ENST00000598968 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.11■■■■■ 4.17
TIMM44-208ENST00000598968 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.97■■■■■ 4.15
TIMM44-208ENST00000598968 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.9■■■■■ 4.14
TIMM44-208ENST00000598968 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.85■■■■■ 4.13
TIMM44-208ENST00000598968 CFTRP13569 1480 aa40.82■■■■■ 4.12
TIMM44-208ENST00000598968 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
TIMM44-208ENST00000598968 CUX2O14529 1486 aa40.75■■■■■ 4.11
TIMM44-208ENST00000598968 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
TIMM44-208ENST00000598968 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.64■■■■■ 4.1
TIMM44-208ENST00000598968 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.6■■■■■ 4.09
TIMM44-208ENST00000598968 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.54■■■■■ 4.08
TIMM44-208ENST00000598968 PRDM2Q13029 1718 aa40.51■■■■■ 4.08
TIMM44-208ENST00000598968 WDR62O43379 1518 aa40.37■■■■■ 4.05
TIMM44-208ENST00000598968 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
TIMM44-208ENST00000598968 ABCC8Q09428 1581 aa39.97■■■■□ 3.99
TIMM44-208ENST00000598968 TOPBP1Q92547 1522 aa39.97■■■■□ 3.99
TIMM44-208ENST00000598968 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.92■■■■□ 3.98
TIMM44-208ENST00000598968 IFT140Q96RY7 1462 aa39.74■■■■□ 3.95
TIMM44-208ENST00000598968 CUX1P39880 1505 aa39.65■■■■□ 3.94
TIMM44-208ENST00000598968 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
TIMM44-208ENST00000598968 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.61■■■■□ 3.93
TIMM44-208ENST00000598968 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.57■■■■□ 3.93
TIMM44-208ENST00000598968 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.55■■■■□ 3.92
TIMM44-208ENST00000598968 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.92
TIMM44-208ENST00000598968 SOGA1O94964 1423 aa39.51■■■■□ 3.92
TIMM44-208ENST00000598968 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.49■■■■□ 3.91
TIMM44-208ENST00000598968 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.4■■■■□ 3.9
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TIMM44-208ENST00000598968 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.37■■■■□ 3.893e-8■■■■□ 23.1
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TIMM44-208ENST00000598968 SYNJ1O43426 1573 aa39.29■■■■□ 3.88
TIMM44-208ENST00000598968 TOP2BQ02880 1626 aa39.29■■■■□ 3.88
TIMM44-208ENST00000598968 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.28■■■■□ 3.88
TIMM44-208ENST00000598968 WDR97A6NE52 1622 aa39.18■■■■□ 3.86
TIMM44-208ENST00000598968 OSCARQ8IYS5 282 aa39.15■■■■□ 3.86
TIMM44-208ENST00000598968 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.12■■■■□ 3.85
TIMM44-208ENST00000598968 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.04■■■■□ 3.84
TIMM44-208ENST00000598968 GRIN2BQ13224 1484 aa39.03■■■■□ 3.84
TIMM44-208ENST00000598968 FBLN2P98095 1184 aa39■■■■□ 3.83
TIMM44-208ENST00000598968 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.98■■■■□ 3.83
TIMM44-208ENST00000598968 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.96■■■■□ 3.83
TIMM44-208ENST00000598968 PBRM1Q86U86 1689 aa38.94■■■■□ 3.82
TIMM44-208ENST00000598968 CHD1O14646 1710 aa38.94■■■■□ 3.82
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TIMM44-208ENST00000598968 SYNJ2O15056 1496 aa38.77■■■■□ 3.8
TIMM44-208ENST00000598968 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.66■■■■□ 3.78
TIMM44-208ENST00000598968 ADAMTS12P58397 1594 aa38.61■■■■□ 3.77
TIMM44-208ENST00000598968 KIF27Q86VH2 1401 aa38.59■■■■□ 3.77
TIMM44-208ENST00000598968 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.57■■■■□ 3.77
TIMM44-208ENST00000598968 TRIM41Q8WV44 630 aa38.53■■■■□ 3.76
TIMM44-208ENST00000598968 GRIN2AQ12879 1464 aa38.51■■■■□ 3.76
TIMM44-208ENST00000598968 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.47■■■■□ 3.75
TIMM44-208ENST00000598968 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.47■■■■□ 3.75
TIMM44-208ENST00000598968 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.47■■■■□ 3.75
TIMM44-208ENST00000598968 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.46■■■■□ 3.75
TIMM44-208ENST00000598968 ARHGEF11O15085 1522 aa38.44■■■■□ 3.74
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TIMM44-208ENST00000598968 CUL7Q14999 1698 aa38.32■■■■□ 3.72
TIMM44-208ENST00000598968 CEP170Q5SW79 1584 aa38.31■■■■□ 3.72
TIMM44-208ENST00000598968 NUP160Q12769 1436 aa38.31■■■■□ 3.72
TIMM44-208ENST00000598968 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.23■■■■□ 3.71
TIMM44-208ENST00000598968 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.23■■■■□ 3.71
TIMM44-208ENST00000598968 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.19■■■■□ 3.7
TIMM44-208ENST00000598968 ARAP1Q96P48 1450 aa38.12■■■■□ 3.69
TIMM44-208ENST00000598968 SHROOM2Q13796 1616 aa38.02■■■■□ 3.68
TIMM44-208ENST00000598968 JPH4Q96JJ6 628 aa38.02■■■■□ 3.68
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