RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494243.5

TTC3-224, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 5

Gene TTC3, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-224ENST00000494243 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.85■■■■■ 7.17
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TTC3-224ENST00000494243 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.98■■■■■ 5.75
TTC3-224ENST00000494243 NACADO15069 1562 aa50.68■■■■■ 5.7
TTC3-224ENST00000494243 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.45■■■■■ 5.67
TTC3-224ENST00000494243 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.21■■■■■ 5.63
TTC3-224ENST00000494243 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.04■■■■■ 5.6
TTC3-224ENST00000494243 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.89■■■■■ 5.58
TTC3-224ENST00000494243 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.83■■■■■ 5.57
TTC3-224ENST00000494243 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.63■■■■■ 5.53
TTC3-224ENST00000494243 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.56■■■■■ 5.52
TTC3-224ENST00000494243 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.44■■■■■ 5.51
TTC3-224ENST00000494243 SCRIBQ14160 1630 aa48.86■■■■■ 5.41
TTC3-224ENST00000494243 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.83■■■■■ 5.41
TTC3-224ENST00000494243 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.36■■■■■ 5.33
TTC3-224ENST00000494243 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.29■■■■■ 5.32
TTC3-224ENST00000494243 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.2■■■■■ 5.31
TTC3-224ENST00000494243 NCAPD3P42695 1498 aa46.83■■■■■ 5.09
TTC3-224ENST00000494243 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.69■■■■■ 5.06
TTC3-224ENST00000494243 SMARCA4P51532 1647 aa46.64■■■■■ 5.06
TTC3-224ENST00000494243 SMARCA2P51531 1590 aa46.52■■■■■ 5.04
TTC3-224ENST00000494243 HMGXB3Q12766 1538 aa46.44■■■■■ 5.03
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TTC3-224ENST00000494243 ERCC6Q03468 1493 aa46.16■■■■■ 4.98
TTC3-224ENST00000494243 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.13■■■■■ 4.98
TTC3-224ENST00000494243 CUX2O14529 1486 aa46.06■■■■■ 4.96
TTC3-224ENST00000494243 NESP48681 1621 aa46.05■■■■■ 4.96
TTC3-224ENST00000494243 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.98■■■■■ 4.95
TTC3-224ENST00000494243 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.7■■■■■ 4.91
TTC3-224ENST00000494243 WIZO95785 1651 aa45.57■■■■■ 4.88
TTC3-224ENST00000494243 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.52■■■■■ 4.88
TTC3-224ENST00000494243 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.43■■■■■ 4.86
TTC3-224ENST00000494243 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.41■■■■■ 4.86
TTC3-224ENST00000494243 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.4■■■■■ 4.86
TTC3-224ENST00000494243 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.24■■■■■ 4.83
TTC3-224ENST00000494243 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.04■■■■■ 4.8
TTC3-224ENST00000494243 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.98■■■■■ 4.79
TTC3-224ENST00000494243 WDR62O43379 1518 aa44.93■■■■■ 4.78
TTC3-224ENST00000494243 CFTRP13569 1480 aa44.91■■■■■ 4.78
TTC3-224ENST00000494243 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.87■■■■■ 4.77
TTC3-224ENST00000494243 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.85■■■■■ 4.77
TTC3-224ENST00000494243 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.51■■■■■ 4.72
TTC3-224ENST00000494243 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.5■■■■■ 4.71
TTC3-224ENST00000494243 PRDM2Q13029 1718 aa44.38■■■■■ 4.69
TTC3-224ENST00000494243 TOPBP1Q92547 1522 aa44.03■■■■■ 4.64
TTC3-224ENST00000494243 OSCARQ8IYS5 282 aa44.02■■■■■ 4.64
TTC3-224ENST00000494243 IFT140Q96RY7 1462 aa43.98■■■■■ 4.63
TTC3-224ENST00000494243 TRIM41Q8WV44 630 aa43.95■■■■■ 4.63
TTC3-224ENST00000494243 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.94■■■■■ 4.63
TTC3-224ENST00000494243 ABCC8Q09428 1581 aa43.92■■■■■ 4.62
TTC3-224ENST00000494243 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.85■■■■■ 4.61
TTC3-224ENST00000494243 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.65■■■■■ 4.58
TTC3-224ENST00000494243 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.64■■■■■ 4.58
TTC3-224ENST00000494243 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.59■■■■■ 4.57
TTC3-224ENST00000494243 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.56■■■■■ 4.562e-7■■■□□ 15.1
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TTC3-224ENST00000494243 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.4■■■■■ 4.54
TTC3-224ENST00000494243 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.4■■■■■ 4.54
TTC3-224ENST00000494243 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.4■■■■■ 4.54
TTC3-224ENST00000494243 SOGA1O94964 1423 aa43.4■■■■■ 4.54
TTC3-224ENST00000494243 CUX1P39880 1505 aa43.33■■■■■ 4.53
TTC3-224ENST00000494243 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.32■■■■■ 4.53
TTC3-224ENST00000494243 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.31■■■■■ 4.52
TTC3-224ENST00000494243 CHD1O14646 1710 aa43.3■■■■■ 4.52
TTC3-224ENST00000494243 ARHGEF11O15085 1522 aa43.29■■■■■ 4.52
TTC3-224ENST00000494243 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.29■■■■■ 4.52
TTC3-224ENST00000494243 FBLN2P98095 1184 aa43.2■■■■■ 4.51
TTC3-224ENST00000494243 WDR97A6NE52 1622 aa43.15■■■■■ 4.5
TTC3-224ENST00000494243 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.08■■■■■ 4.49
TTC3-224ENST00000494243 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.99■■■■■ 4.47
TTC3-224ENST00000494243 GRIN2BQ13224 1484 aa42.99■■■■■ 4.47
TTC3-224ENST00000494243 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.97■■■■■ 4.47
TTC3-224ENST00000494243 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.92■■■■■ 4.46
TTC3-224ENST00000494243 ARAP1Q96P48 1450 aa42.88■■■■■ 4.46
TTC3-224ENST00000494243 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.87■■■■■ 4.45
TTC3-224ENST00000494243 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.85■■■■■ 4.45
TTC3-224ENST00000494243 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.85■■■■■ 4.45
TTC3-224ENST00000494243 SYNJ2O15056 1496 aa42.84■■■■■ 4.45
TTC3-224ENST00000494243 PBRM1Q86U86 1689 aa42.79■■■■■ 4.44
TTC3-224ENST00000494243 SYNJ1O43426 1573 aa42.78■■■■■ 4.44
TTC3-224ENST00000494243 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.76■■■■■ 4.44
TTC3-224ENST00000494243 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.7■■■■■ 4.43
TTC3-224ENST00000494243 TOP2BQ02880 1626 aa42.64■■■■■ 4.42
TTC3-224ENST00000494243 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.64■■■■■ 4.42
TTC3-224ENST00000494243 GRIN2AQ12879 1464 aa42.44■■■■■ 4.38
TTC3-224ENST00000494243 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.43■■■■■ 4.38
TTC3-224ENST00000494243 ADAMTS12P58397 1594 aa42.41■■■■■ 4.38
TTC3-224ENST00000494243 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.32■■■■■ 4.37
TTC3-224ENST00000494243 NUP160Q12769 1436 aa42.32■■■■■ 4.37
TTC3-224ENST00000494243 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.3■■■■■ 4.36
TTC3-224ENST00000494243 CEP170Q5SW79 1584 aa42.29■■■■■ 4.36
TTC3-224ENST00000494243 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.22■■■■■ 4.35
TTC3-224ENST00000494243 SHROOM2Q13796 1616 aa42.1■■■■■ 4.33
TTC3-224ENST00000494243 JPH4Q96JJ6 628 aa41.9■■■■■ 4.3
TTC3-224ENST00000494243 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
TTC3-224ENST00000494243 IGF1RP08069 1367 aa41.85■■■■■ 4.29
TTC3-224ENST00000494243 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.81■■■■■ 4.28
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