RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552897.5

TPCN1-222, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 4

Gene TPCN1, Length 596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-222	ENST00000552897	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		58.72	■■■■■ 6.99
TPCN1-222	ENST00000552897	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		52.04	■■■■■ 5.92
TPCN1-222	ENST00000552897	ABCC9	O60706	1549 aa		51.03	■■■■■ 5.76
TPCN1-222	ENST00000552897	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		49.11	■■■■■ 5.45
TPCN1-222	ENST00000552897	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		48.98	■■■■■ 5.43
TPCN1-222	ENST00000552897	NACAD	O15069	1562 aa		48.96	■■■■■ 5.43
TPCN1-222	ENST00000552897	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	48.92	■■■■■ 5.42
TPCN1-222	ENST00000552897	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		48.68	■■■■■ 5.38
TPCN1-222	ENST00000552897	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		48.52	■■■■■ 5.36
TPCN1-222	ENST00000552897	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		47.92	■■■■■ 5.26
TPCN1-222	ENST00000552897	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	47.78	■■■■■ 5.24
TPCN1-222	ENST00000552897	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		47.62	■■■■■ 5.21
TPCN1-222	ENST00000552897	SCRIB	Q14160	1630 aa		47.61	■■■■■ 5.21
TPCN1-222	ENST00000552897	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		46.95	■■■■■ 5.11
TPCN1-222	ENST00000552897	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		46.93	■■■■■ 5.1
TPCN1-222	ENST00000552897	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	46.3	■■■■■ 5
TPCN1-222	ENST00000552897	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		46.11	■■■■■ 4.97
TPCN1-222	ENST00000552897	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		45.84	■■■■■ 4.93
TPCN1-222	ENST00000552897	SMARCA4	P51532	1647 aa		45.52	■■■■■ 4.88
TPCN1-222	ENST00000552897	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	45.44	■■■■■ 4.86
TPCN1-222	ENST00000552897	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		45.31	■■■■■ 4.84
TPCN1-222	ENST00000552897	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		45.31	■■■■■ 4.84
TPCN1-222	ENST00000552897	NCAPD3	P42695	1498 aa		45.25	■■■■■ 4.83
TPCN1-222	ENST00000552897	SMARCA2	P51531	1590 aa		45.15	■■■■■ 4.82
TPCN1-222	ENST00000552897	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		45.05	■■■■■ 4.8
TPCN1-222	ENST00000552897	HMGXB3	Q12766	1538 aa		44.96	■■■■■ 4.79
TPCN1-222	ENST00000552897	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	44.88	■■■■■ 4.78
TPCN1-222	ENST00000552897	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	44.82	■■■■■ 4.77
TPCN1-222	ENST00000552897	WIZ	O95785	1651 aa		44.79	■■■■■ 4.76
TPCN1-222	ENST00000552897	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	44.27	■■■■■ 4.68
TPCN1-222	ENST00000552897	NES	P48681	1621 aa		44.22	■■■■■ 4.67
TPCN1-222	ENST00000552897	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		43.96	■■■■■ 4.63
TPCN1-222	ENST00000552897	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		43.94	■■■■■ 4.63
TPCN1-222	ENST00000552897	ERCC6	Q03468	1493 aa		43.89	■■■■■ 4.62
TPCN1-222	ENST00000552897	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		43.83	■■■■■ 4.61
TPCN1-222	ENST00000552897	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	43.78	■■■■■ 4.6
TPCN1-222	ENST00000552897	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		43.7	■■■■■ 4.59
TPCN1-222	ENST00000552897	CFTR	P13569	1480 aa		43.69	■■■■■ 4.58
TPCN1-222	ENST00000552897	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		43.59	■■■■■ 4.57
TPCN1-222	ENST00000552897	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	43.43	■■■■■ 4.54
TPCN1-222	ENST00000552897	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		43.43	■■■■■ 4.54
TPCN1-222	ENST00000552897	CUX2	O14529	1486 aa		43.38	■■■■■ 4.53
TPCN1-222	ENST00000552897	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		43.32	■■■■■ 4.53
TPCN1-222	ENST00000552897	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		43.26	■■■■■ 4.52
TPCN1-222	ENST00000552897	PRDM2	Q13029	1718 aa		43.21	■■■■■ 4.51
TPCN1-222	ENST00000552897	WDR62	O43379	1518 aa		43.12	■■■■■ 4.49
TPCN1-222	ENST00000552897	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	43.03	■■■■■ 4.48
TPCN1-222	ENST00000552897	TOPBP1	Q92547	1522 aa		42.75	■■■■■ 4.43
TPCN1-222	ENST00000552897	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		42.65	■■■■■ 4.42
TPCN1-222	ENST00000552897	ABCC8	Q09428	1581 aa		42.65	■■■■■ 4.42
TPCN1-222	ENST00000552897	CUX1	P39880	1505 aa		42.48	■■■■■ 4.39
TPCN1-222	ENST00000552897	IFT140	Q96RY7	1462 aa		42.43	■■■■■ 4.38
TPCN1-222	ENST00000552897	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	42.39	■■■■■ 4.38
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	42.33	■■■■■ 4.37
TPCN1-222	ENST00000552897	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		42.3	■■■■■ 4.36
TPCN1-222	ENST00000552897	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		42.28	■■■■■ 4.36
TPCN1-222	ENST00000552897	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	42.27	■■■■■ 4.36
TPCN1-222	ENST00000552897	SOGA1	O94964	1423 aa		42.23	■■■■■ 4.35
TPCN1-222	ENST00000552897	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	42.2	■■■■■ 4.35
TPCN1-222	ENST00000552897	SYNJ1	O43426	1573 aa		42.12	■■■■■ 4.33
TPCN1-222	ENST00000552897	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	42.1	■■■■■ 4.33	2e-7	■■■■□ 20.6
TPCN1-222	ENST00000552897	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		42.09	■■■■■ 4.33
TPCN1-222	ENST00000552897	TOP2B	Q02880	1626 aa		42.06	■■■■■ 4.32
TPCN1-222	ENST00000552897	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	42.05	■■■■■ 4.32
TPCN1-222	ENST00000552897	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	42.04	■■■■■ 4.32
TPCN1-222	ENST00000552897	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		42.04	■■■■■ 4.32
TPCN1-222	ENST00000552897	WDR97	A6NE52	1622 aa		41.88	■■■■■ 4.3
TPCN1-222	ENST00000552897	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		41.88	■■■■■ 4.29
TPCN1-222	ENST00000552897	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		41.72	■■■■■ 4.27
TPCN1-222	ENST00000552897	GRIN2B	Q13224	1484 aa		41.68	■■■■■ 4.26
TPCN1-222	ENST00000552897	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		41.68	■■■■■ 4.26
TPCN1-222	ENST00000552897	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		41.67	■■■■■ 4.26
TPCN1-222	ENST00000552897	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		41.66	■■■■■ 4.26
TPCN1-222	ENST00000552897	PBRM1	Q86U86	1689 aa		41.55	■■■■■ 4.24
TPCN1-222	ENST00000552897	FBLN2	P98095	1184 aa		41.55	■■■■■ 4.24
TPCN1-222	ENST00000552897	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	41.53	■■■■■ 4.24
TPCN1-222	ENST00000552897	CHD1	O14646	1710 aa		41.51	■■■■■ 4.24
TPCN1-222	ENST00000552897	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	41.42	■■■■■ 4.22
TPCN1-222	ENST00000552897	SYNJ2	O15056	1496 aa		41.41	■■■■■ 4.22
TPCN1-222	ENST00000552897	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		41.34	■■■■■ 4.21
TPCN1-222	ENST00000552897	KIF27	Q86VH2	1401 aa		41.29	■■■■■ 4.2
TPCN1-222	ENST00000552897	TRIM41	Q8WV44	630 aa		41.28	■■■■■ 4.2
TPCN1-222	ENST00000552897	ADAMTS12	P58397	1594 aa		41.28	■■■■■ 4.2
TPCN1-222	ENST00000552897	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		41.23	■■■■■ 4.19
TPCN1-222	ENST00000552897	IGF1R	P08069	1367 aa		41.22	■■■■■ 4.19
TPCN1-222	ENST00000552897	GRIN2A	Q12879	1464 aa		41.16	■■■■■ 4.18
TPCN1-222	ENST00000552897	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		41.1	■■■■■ 4.17
TPCN1-222	ENST00000552897	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		41.09	■■■■■ 4.17
TPCN1-222	ENST00000552897	NUP160	Q12769	1436 aa		41	■■■■■ 4.15
TPCN1-222	ENST00000552897	ARHGEF11	O15085	1522 aa		40.98	■■■■■ 4.15
TPCN1-222	ENST00000552897	CEP170	Q5SW79	1584 aa		40.98	■■■■■ 4.15
TPCN1-222	ENST00000552897	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		40.97	■■■■■ 4.15
TPCN1-222	ENST00000552897	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		40.97	■■■■■ 4.15
TPCN1-222	ENST00000552897	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		40.97	■■■■■ 4.15
TPCN1-222	ENST00000552897	CUL7	Q14999	1698 aa		40.92	■■■■■ 4.14
TPCN1-222	ENST00000552897	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		40.92	■■■■■ 4.14
TPCN1-222	ENST00000552897	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		40.92	■■■■■ 4.14
TPCN1-222	ENST00000552897	ARAP1	Q96P48	1450 aa		40.7	■■■■■ 4.11
TPCN1-222	ENST00000552897	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		40.67	■■■■■ 4.1
TPCN1-222	ENST00000552897	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		40.64	■■■■■ 4.1

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms