Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DNAJB4Q9UDY4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DNAJB4Q9UDY4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAJB4Q9UDY4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAJB4Q9UDY4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAJB4Q9UDY4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAJB4Q9UDY4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAJB4Q9UDY4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAJB4Q9UDY4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAJB4Q9UDY4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAJB4Q9UDY4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAJB4Q9UDY4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNAJB4Q9UDY4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNAJB4Q9UDY4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNAJB4Q9UDY4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNAJB4Q9UDY4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNAJB4Q9UDY4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNAJB4Q9UDY4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNAJB4Q9UDY4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNAJB4Q9UDY4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DNAJB4Q9UDY4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DNAJB4Q9UDY4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DNAJB4Q9UDY4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DNAJB4Q9UDY4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DNAJB4Q9UDY4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DNAJB4Q9UDY4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAJB4Q9UDY4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DNAJB4Q9UDY4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNAJB4Q9UDY4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNAJB4Q9UDY4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNAJB4Q9UDY4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAJB4Q9UDY4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAJB4Q9UDY4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAJB4Q9UDY4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAJB4Q9UDY4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAJB4Q9UDY4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAJB4Q9UDY4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAJB4Q9UDY4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAJB4Q9UDY4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAJB4Q9UDY4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms