Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVMER34-1Q9H9K5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVMER34-1Q9H9K5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERVMER34-1Q9H9K5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVMER34-1Q9H9K5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms