Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KATNB1Q9BVA0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KATNB1Q9BVA0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KATNB1Q9BVA0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms