Protein–RNA interactions for Protein: Q99704

DOK1, Docking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DOK1Q99704 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DOK1Q99704 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DOK1Q99704 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DOK1Q99704 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DOK1Q99704 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DOK1Q99704 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DOK1Q99704 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DOK1Q99704 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DOK1Q99704 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DOK1Q99704 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DOK1Q99704 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DOK1Q99704 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DOK1Q99704 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DOK1Q99704 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DOK1Q99704 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DOK1Q99704 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DOK1Q99704 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DOK1Q99704 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DOK1Q99704 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DOK1Q99704 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DOK1Q99704 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DOK1Q99704 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DOK1Q99704 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DOK1Q99704 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DOK1Q99704 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DOK1Q99704 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms