Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PAF1Q8N7H5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAF1Q8N7H5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.6 ms