Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAPOLAP51003 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms