Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB6P18564 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB6P18564 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms